Muster rund

Unterschiedliche Taxonprofile zwischen generalistischen Kanten und fachlichen Kanten, die generalistische Scheitelpunkte verknüpfen, deuten darauf hin, dass generalistische Taxa unterschiedliche Ko-Vorkommensmuster in verschiedenen Umgebungen anzeigen könnten. Wir fanden heraus, dass die am häufigsten vorkommenden generalistischen Kanten alle mit Sphingobacterium verbunden waren, die im Boden [26], Wasser [27] und tierischen [28] oder pflanzenassoziierten Mikrobiomen allgegenwärtig sind [29]. Die allgegenwärtige Existenz kann jedoch die Bildung generalistischer Kanten nicht garantieren, da wesentliche Spezialkanten generalistische Scheitelpunktpaare miteinander verknüpften. Beispielsweise sind Mikrogenomate und Armatimonadetes in 11 Umgebungen mitvorhanden, bilden aber nur Kanten im subtalen Darm-Subnetz von Tieren. Öffnen Sie die Textur oder das Muster, die Sie um Ihr Objekt wickeln möchten (in diesem Fall meine Hand) In Bezug auf Phylogenie wurde eine nicht zufällige Kantenverteilung über Taxa beobachtet, wobei die meisten Ko-Vorkommensbeziehungen von Alphaproteobacteria, Clostridia und Deltaproteobacteria (Abb. 2a) Klassen abgeleitet wurden. Die meisten Kombinationen zwischen dominanten Klassen sind überrepräsentiert als die Zufallsfrequenz (Abb. 2b). Allerdings sind nur bestimmte Kombinationen zwischen seltenen Klassen, wie Flavobacteriia und Gemmatinonadetes, Bacteroidia und Anaeroblineae, und Gemmatinonadetes und Bacteroidia, überrepräsentiert als zufällige Häufigkeit. Denn innerhalb von Taxa-Ko-Vorkommen waren nur Co-Vorkommen innerhalb der Deltaproteobacteria-, Planctomycetia-, Anaerolineae- und Acidobacteria-Gp2-Klassen überrepräsentiert als die Zufallshäufigkeit. Da die Subnetze für verschiedene Umgebungen unterschiedliche Ko-Vorkommensmuster aufweisen, waren bestimmte Zusammenauftretensbeziehungen nur in bestimmten Umgebungen überrepräsentiert als die Zufallshäufigkeit (Abb. 2c).

Lassen Sie uns nun ein anderes Muster erstellen, das als ein einzelner Punkt beginnt. Das ist es, was Sie zeichnen werden: Verschiedene Profile topologischer Merkmale entlang der Subnetzwerke verschiedener Umgebungen deuten auf einzigartige mikrobielle Ko-Vorkommensmuster in verschiedenen Umgebungen hin. Große Kantenzahlen im tierischen Distaldarm-Subnetz deuten auf eine hohe Dichte von Wechselwirkungen in dieser Umgebung hin. Höhere Clusterkoeffizienten in den Subnetzen von proximalen Tierdarm- und Salinesedimenten könnten auf Kreuzfütterungsbeziehungen hindeuten, was auf einen Reichtum an Abbaupfaden, Nischenfiltern oder Umweltheterogenität in solchen Umgebungen hindeutet.

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